1. "Нули" учитывать не нужно. А у Вас они повлияют на значение среднего арифметического для положительных чисел.

2. Чему равно значение K1 при самом первом выполнении блока K1:= K1+1 ? Аналогичный вопрос - для K2.

3. Чему равно значение S1 при самом первом выполнении блока С1 := S1+X(I,I) ? Аналогичный вопрос - для S2.

4. Допустим, блок С1 := S1+X(I,I) выполнился три раза. Эти три раза повлияли как-то на значение C1 на выходе из цикла, там, где вычисляется среднее арифметическое? Аналогично - для C2.

Если непонятно, что за замечания я сделал, возьмите простенькую матрицу 2x3 и "в тупую" пройдитесь по своей блок-схеме. Только делайте именно то, что Вы написали-нарисовали, а не то, что кажется логичным сделать.