Там точка с запятой лишняя, ну и немного отформатировал, так красивее :-). И private можно не писать.
Код
// 2_1.cpp : Defines the entry point for the console application.
//include "stdafx.h"
#include <fstream>
#include <iostream>
#include <string>
#include <cstring>
#include <stdlib.h>
using namespace std;

class Stack
{
    static const int MAX = 80;
    int st[MAX];
    int top;
public:
    Stack()
    {
        top=0;
    }
    void push (int var)
    {
        st[++top]=var;
    }
    int pop( )
    {
        return st[top--];
    }
};

int main()
{
    Stack s1;
    const int MAX=80;
    char buffer[3][MAX];
    int i=0;
    int x,j,dlina,k;
    char z;
    ifstream infile("input.txt");
    while (!infile.eof())
    {
        infile.getline(buffer[i],MAX);
        cout << buffer[i] << endl;
        i++;       //считали данные в массив строк
    };
    k=0;
    dlina=0;
    for (i=0;i<3;i++)
    {
        x=strlen(buffer[i]);
        dlina=dlina+x;
        for (j=0;j<=x;j++)                      //данные из массива помещаем в стек
        {
            s1.push(buffer[i][j]);
            k++;
        };
    };
    for (z='A';z<='Z';z++)
    {
        for (i=0;i<=k;i++)              //выводим данные из стека в алфавитном
        {
            if ((s1.pop()==z)||(s1.pop()==(z+32)))
                {
                    cout << s1.pop() << endl << "\n";
                };
        };
    };
return 0;
}